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Partager le résultat de cette rechercheIntegrating phylogenomics, phylogenetics, morphometrics, relative genome size and ecological niche modelling disentangles the diversification of Eurasian Euphorbia seguieriana s. l. (Euphorbiaceae) / Bozo Frajman in Molecular Phylogenetics and Evolution, vol. 134 (Année 2019)
Titre : Integrating phylogenomics, phylogenetics, morphometrics, relative genome size and ecological niche modelling disentangles the diversification of Eurasian Euphorbia seguieriana s. l. (Euphorbiaceae) Type de document : texte imprimé Auteurs : Bozo Frajman, Auteur ; Eliska Záveská, Auteur ; Alexander Gamisch, Auteur ; Tim Moser, Auteur ; The STEPPE Consortium, Auteur ; Peter Schönswetter, Auteur Année de publication : 2019 Article en page(s) : pp. 238-252 Langues : Anglais (eng) Catégories : [Espèces (in biblio)] Euphorbia seguieriana
[Thèmes] TaxonomieMots-clés : modélisation niche écologique morphométrie multivariée RADseq Résumé : "Next generation sequencing has revolutionised biology. Restriction-associated DNA sequencing (RADseq) has primarily been used to study infraspecific relationships but has also been applied in multi-species phylogenomic analyses. In this study, we used a combination of phylogenomic (with RADseq data) and phylogenetic (with sequences of the nuclear internal transcribed spacer, ITS) methods to explore relationships within the taxonomically intricate Euphorbia seguieriana s. l., one of the most widespread Euphorbia taxa inhabiting zonal and extrazonal steppes from Iberia to Central Asia. In the inferred phylogenies the southeastern Balkan and Anatolian populations were clearly separated, supporting the distinction of E. niciciana from E. seguieriana at the species level. Within E. seguieriana, the populations from the Caucasus, Iran, and easternmost Anatolia were sister to all other populations based on RADseq, making necessary the description of a new, morphologically divergent subspecies, E. seguieriana subsp. armeniaca. Conversely, additional studies are needed to understand the status of E. seguieriana subsp. hohenackeri, which is sympatric with E. seguieriana subsp. armeniaca. Niche analyses indicated that differences in the climatic niche between E. niciciana and E. seguieriana are relatively small compared with the climatic differences between the regions over which they are distributed. Contrary to previous believes, E. niciciana and E. seguieriana are allopatric and have likely diverged during the Pleistocene in two different glacial refugia as suggested by distribution modelling. Euphorbia niciciana nowadays has a submediterranean distribution, occupying habitats that are slightly warmer, moister, and less seasonal in temperature but more seasonal in precipitation than E. seguieriana, a characteristic species of continental steppes. Using flow cytometry, we demonstrate that the relative genome sizes of E. niciciana and E. seguieriana differ significantly. Additionally, multivariate morphometric analyses of 56 morphological characters indicated clear morphological divergence of the two species. Importantly, we also provide a revised taxonomic treatment including formal nomenclatural changes, an identification key and species descriptions. Our study demonstrates that an integrative approach, combining modern phylogenomic methods with traditional phylogenetic, cytogenetic, environmental and morphological analyses can result in satisfactorily resolved relationships in intricate groups of closely related species. Finally, phylogenetic inference using ITS sequences is still a useful tool for resolving relationships among the taxa at the species level, but the phylogenomic approach based on RADseq data certainly provides better resolution both among and within species." (source : auteurs) Type de publication : périodique Référence biblio : Frajman B., Záveská E., Gamisch A., Moser T., The STEPPE Consortium, Schönswetter P., 2019 - Integrating phylogenomics, phylogenetics, morphometrics, relative genome size and ecological niche modelling disentangles the diversification of Eurasian Euphorbia seguieriana s. l. (Euphorbiaceae). Molecular Phylogenetics and Evolution, 134 : 238-252. ID PMB : 70642 En ligne : https://reader.elsevier.com/reader/sd/pii/S1055790318305529?token=430691F9947870 [...] Format de la ressource électronique : document Permalink : http://www.cbnbrest.fr/catalogue_en_ligne/index.php?lvl=notice_display&id=70642
in Molecular Phylogenetics and Evolution > vol. 134 (Année 2019) . - pp. 238-252[article]Exemplaires(0)
Disponibilité aucun exemplaire Ecologie des Lythrum annuels des mares temporaires méditerranéennes : applications à la conservation de L. thesioides dans les Costières de Nîmes / Antoine Gazaix (2019)
Titre : Ecologie des Lythrum annuels des mares temporaires méditerranéennes : applications à la conservation de L. thesioides dans les Costières de Nîmes Type de document : texte imprimé Auteurs : Antoine Gazaix, Auteur ; Université de Montpellier (Montpellier), Organisme de soutenance Année de publication : 2019 Importance : 178 p. + annexes Langues : Français (fre) Catégories : [ZG] NIMES (30189)
[Espèces (in biblio)] Lythraceae
[Espèces (in biblio)] Lythrum borysthenicum
[habitats/milieux] ZH - Zones humides
[Thèmes] Conservation
[Thèmes] Germination des grainesMots-clés : gestion des écosystèmes niche écologique milieu anthropisé hydrologie plante annuelle Résumé : "Les communautés de plantes des mares temporaires méditerranéennes sont caractérisées par la dominance des espèces annuelles, avec une banque de graines persistante, dont la germination est associée aux alternances d’inondation et d’assèchement. Bien que de petites tailles et irrégulièrement distribuées dans les paysages, elles possèdent une flore riche. Elles ont cependant été particulièrement détruites et dégradés, et de nombreuses espèces inféodées à cet habitat sont aujourd’hui rares et menacées. Parmi elles, six espèces annuelles du genre Lythrum sont présentes dans le sud de la France, dont Lythrum thesioides. Cette espèce supposée éteinte en Europe au milieu du XX° siècle, a été redécouverte successivement à partir de 1998 dans 3 mares temporaires méditerranéennes de France. Les objectifs de cette thèse sont (1) de caractériser les niches écologiques de ces six espèces et (2) d’utiliser cette connaissance pour proposer des actions de gestion pertinentes pour leur conservation, notamment pour L. thesioides. La première étape a été de clarifier la distribution de ces 6 espèces annuelles dans la région méditerranéenne et particulièrement celle de Lythrum thesioides. Ce travail s’est accompagné d’une étude phylogénétique des relations entre les six espèces et 13 autres du genre Lythrum. La comparaison des niches de régénération a ensuite illustré l’importance de plusieurs variables environnementales pour la germination, et principalement la température optimale de germination qui était différente entre les espèces et particulièrement élevée pour L. thesioides. L’étude des micro-niches des plantes adultes a enfin démontré une différentiation franche entre les espèces en termes de propriété du sol, et dans une moindre mesure, de présence et phénologie de la communauté végétale compagne. La combinaison des résultats de ce travail, caractérisant une niche écologique originale pour L. thesioides, a enfin été utilisée pour alimenter des propositions de gestion, composée de plusieurs scénarios pour la conservation de L. thesioides dans sa principale population dans le sud de la France." (source : auteur) Type de publication : thèse, mémoire, stage Référence biblio : Gazaix A., 2019 - Ecologie des Lythrum annuels des mares temporaires méditerranéennes : applications à la conservation de L. thesioides dans les Costières de Nîmes. Thèse de doctorat en Ecologie et biodiversité. Montpellier : Université de Montpellier, 178 p. + annexes. ID PMB : 70149 En ligne : https://theses.hal.science/tel-02611002 Format de la ressource électronique : document Permalink : http://www.cbnbrest.fr/catalogue_en_ligne/index.php?lvl=notice_display&id=70149 Exemplaires(0)
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Titre : Inventaires et atlas nationaux de distribution : pour une approche plus itérative et un rééquilibrage taxinomique Type de document : texte imprimé Auteurs : Julien Touroult, Auteur ; Laurent Poncet, Auteur ; Philippe Keith, Auteur ; Vincent Boullet (....-2024), Auteur ; Gérard Arnal (1947-....), Auteur ; Hervé Brustel, Auteur ; Jean-Philippe Siblet, Auteur Année de publication : 2015 Article en page(s) : pp. 97-120 Langues : Français (fre) Catégories : [Thèmes] Atlas floristique
[Thèmes] TaxonomieMots-clés : atlas inventaire niche écologique conservation modélisation Résumé : "Cette synthèse analyse les utilisations et les limites des atlas nationaux de distribution d’espèces et de leurs données d’inventaires dans le domaine appliqué à la conservation de la nature. À partir des lacunes et des opportunités techniques constatées en France, nous proposons une série de recommandations pratiques et scientifiques afin de renforcer leur utilisation dans les démarches de planification spatiale de la conservation de la biodiversité terrestre (aires protégées, réseaux écologiques, aménagement du territoire). Les deux principaux aspects concernent la mise en place d’une démarche itérative et le choix des groupes d’espèces. La démarche itérative consiste à analyser régulièrement les données disponibles validées afin d’identifier les lacunes de prospection, modéliser la distribution potentielle des espèces et estimer leur niche écologique. Ces informations doivent ensuite faciliter le processus de validation, en triant les nouvelles données selon leur vraisemblance au regard de l’occurrence et de la niche et servir à définir de nouveaux territoires à inventorier prioritairement. Comme la littérature montre que les zones importantes pour la conservation varient suivant les groupes d’espèces, nous proposons d’augmenter la représentativité taxinomique avec de nouveaux atlas, afin d’apporter une vision plus complète de la distribution des espèces pour les dispositifs de conservation. Idéalement, les groupes inventoriés doivent être riches en espèces à répartition restreinte et peu mobiles et/ou présenter une forte proportion d’espèces spécialistes de certains milieux et/ou jouant un rôle reconnu dans les processus écologiques." (source : auteurs) Type de publication : périodique Référence biblio : Touroult J., Poncet L., Keith P., Boullet V., Arnal G., Brustel H., Siblet J.-P., 2015 - Inventaires et atlas nationaux de distribution : pour une approche plus itérative et un rééquilibrage taxinomique. Revue d'écologie, 70 (2) : 97-120. ID PMB : 61962 Permalink : http://www.cbnbrest.fr/catalogue_en_ligne/index.php?lvl=notice_display&id=61962
in Revue d'écologie > vol. 70, n°2 (Année 2015) . - pp. 97-120[article]Exemplaires(0)
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