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Mise en oeuvre du modèle agro-hydrologique SWAT sur la partie amont du bassin versant du Loch : vers une modélisation du transfert des nutriments / Nicolas Rollo in Cahiers nantais, n°2008-1 (Année 2008)

Public [article]  inCahiers nantais > n°2008-1 (Année 2008) . - pp. 17-26 Titre : Mise en oeuvre du modèle agro-hydrologique SWAT sur la partie amont du bassin versant du Loch : vers une modélisation du transfert des nutriments Type de document : texte imprimé Auteurs : Nicolas Rollo, Auteur ; Gildas Levesque, Auteur ; Etienne Chauveau, Auteur ; Marc Robin, Auteur Année de publication : 2008 Article en page(s) : pp. 17-26 Langues : Français (fre) Catégories : [ZG] MORBIHAN (56) [habitats/milieux] 2 - Milieux aquatiques non marins Mots-clés : hydrologie  modélisation  pollution diffuse  bassin versant  SWAT Résumé : "Depuis plusieurs années, les acteurs du bassin versant de la rivière d'Auray sont confrontés à des problèmes récurrents de dégradation de la qualité des eaux du Loc'h. Plusieurs études ont montré que cette médiocre qualité est en grande partie imputable aux pollutions agricoles diffuses. L'objectif de ce travail est d'évaluer la faisabilité d'une modélisation agro-hydrologique de ce bassin versant afin de quantifier les phénomènes de pollution diffuse, d'apprécier leurs origines ainsi que leur distribution spatiale. Cette démarche a pour finalité d'aboutir à la constitution d'un outil opérationnel d'aide à la décision proposant des secteurs d'intervention prioritaires pour les actions de restauration de la qualité des eaux." (source : auteurs) Type de publication : périodique Référence biblio : Rollo N., Levesque G., Chauveau E., Robin M., 2008 - Mise en oeuvre du modèle agro-hydrologique SWAT sur la partie amont du bassin versant du Loch : vers une modélisation du transfert des nutriments. Cahiers nantais, 2008-1 : 17-26. ID PMB : 64962 Permalink : http://www.cbnbrest.fr/catalogue_en_ligne/index.php?lvl=notice_display&id=64962 [article]

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Programme les sentinelles du climat, tome III. Cadre de la modélisation prédictive des réponses des espèces face au changement climatique en Nouvelle-Aquitaine / Fanny Mallard (2017)    

Public Titre : Programme les sentinelles du climat, tome III. Cadre de la modélisation prédictive des réponses des espèces face au changement climatique en Nouvelle-Aquitaine Type de document : texte imprimé Auteurs : Fanny Mallard, Directeur de publication Editeur : Le Haillan : Cistude nature Année de publication : 2017 Oeuvres / Expressions : Programme les sentinelles du climat Importance : 90 p. Note générale : Ce document est réalisé dans le cadre du programme de recherche appliquée « Les sentinelles du climat » (2016-2021) sur l’étude des effets du changement climatique sur la biodiversité à l’échelle de la région Nouvelle-Aquitaine. Langues : Français (fre) Catégories : [Thèmes] Biodiversité [Thèmes] Changement climatique [ZG] NOUVELLE AQUITAINE Mots-clés : données  indicateur  protocole  species distribution modeling (SDM)  modélisation Résumé : "La compréhension des effets locaux du changement climatique sur la biodiversité est essentielle pour orienter les politiques environnementales et de gestion des espaces naturels. Le manque de connaissances au niveau régional a conduit au développement d’un programme de recherche « les sentinelles du climat ». L’hypothèse principale est que les effets sur la biodiversité sont particulièrement détectables chez des espèces ou groupes d’espèces qui ont de faibles capacités de déplacements. Ces espèces « sentinelles du climat » seraient les premières à répondre aux variations climatiques locales par adaptation ou par extinction locale. La région Nouvelle-Aquitaine est un contexte géographique intéressant car à la fois elle est exposée à l’évolution du climat et elle offre une grande variété d’écosystèmes naturels. A partir du territoire, une vingtaine d’indicateurs du changement climatique ont été développés dans différents écosystèmes suivant une méthode basée sur la production scientifique internationale et les connaissances empiriques naturalistes. Dans le cadre de la mise en place de l’analyse des données résultantes, un premier travail a été réalisé sur une synthèse bibliographique permettant de lister et de caractériser différents modèles existants et utilisés spécifiquement dans la recherche sur le changement climatique et ses impacts sur la répartition de la biodiversité. Des articles de revue à impact factor ont été sélectionnés et exploités afin de déterminer leurs pertinences pour les indicateurs choisis dans le programme. Un grand nombre de modèles ont été recensés allant des plus simples aux plus complexes. Chaque modèle possède ses avantages et ses limites, une combinaison de modèles est souhaitable pour consolider les hypothèses et permet d’obtenir des cartes prédictives plus fiables Par conséquent, la modélisation d’ensemble a été considérée comme la meilleure solution pour réduire les incertitudes et les biais. La prochaine phase est de développer et de tester l’outil retenu en intégrant peu à peu les données recueillies sur le terrain pour les analyser et aborder leurs extrapolations." (source : auteur) Type de publication : rapport d'études Référence biblio : Mallard F. (coord.), 2017 - Programme les sentinelles du climat, tome III. Cadre de la modélisation prédictive des réponses des espèces face au changement climatique en Nouvelle-Aquitaine. Le Haillan : Cistude nature, 90 p. ID PMB : 70301 En ligne : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01804160v2 Format de la ressource électronique : document Permalink : http://www.cbnbrest.fr/catalogue_en_ligne/index.php?lvl=notice_display&id=70301

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• Programme les sentinelles du climat, tome IV. Ajustement des protocoles d’échantillonnage et analyses exploratoires des indicateursdes effets duchangement climatique sur la biodiversité en Nouvelle-Aquitaine / Fanny Mallard (2017)  

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Programme les sentinelles du climat, tome V. Prise en compte des éléments paysagers dans la modélisation des répartitions des espèces sentinelles du climat / Emmeline Lobry (2018)  

Public Titre : Programme les sentinelles du climat, tome V. Prise en compte des éléments paysagers dans la modélisation des répartitions des espèces sentinelles du climat Type de document : texte imprimé Auteurs : Emmeline Lobry, Auteur ; Fanny Mallard, Directeur de publication ; Laurent Couderchet, Auteur Editeur : Le Haillan : Cistude nature Année de publication : 2018 Oeuvres / Expressions : Programme les sentinelles du climat Importance : 91 p. Note générale : Ce document est réalisé dans le cadre du programme de recherche appliquée « Les sentinelles du climat » (2016-2021) sur l’étude des effets du changement climatique sur la biodiversité à l’échelle de la région Nouvelle-Aquitaine. Langues : Français (fre) Catégories : [Thèmes] Biodiversité [Thèmes] Changement climatique [Thèmes] Occupation du sol [Thèmes] Télédétection [ZG] NOUVELLE AQUITAINE Mots-clés : indice paysager  métrique paysagère  modélisation  méthodologie  phénologie Résumé : "Ce travail présente la mise en place d’indices paysagers permettant de décrire les processus écologiques à l’œuvre, parallèlement aux effets du changement climatique, sur les sites de suivi du programme scientifique Les sentinelles du climat. Les indices sont calculés à partir de données d’occupation du sol. Les données existantes ne sont pas appropriées pour l’étude des espèces à faible capacité de déplacement suivies dans ce programme. Des données d’occupation du sol à fine résolution spatiale et thématique ont donc été créées. Le protocole mis en Å“uvre mobilise la méthode de classification par K-moyennes d’un corpus d’images satellite, à deux périodes de l’année pour intégrer la phénologie, et du Modèle Numérique de Terrain. Des données exogènes complètent et/ou précisent la connaissance de certains éléments mal reconnus par la méthode de télédétection. Les cartographies obtenues permettent d’affiner les données d’occupation du sol connues en prenant en compte l’hétérogénéité interne des classes. Ce protocole hybride, les méthodes de télédétection et de photo-interprétation mobilisent des sources de données très hétérogènes. La singularité de cette méthode s’explique par la nécessité de la réplicabilité du protocole et d’une application concrète des résultats obtenus dans le cadre de la modélisation de la répartition des espèces sentinelles. Des indices paysagers, qui serviront à la modélisation globale du programme pour hiérarchiser les sites de suivi en fonction de leur pertinence à isoler au maximum le facteur changement climatique, ont été calculés. Ils ont permis de caractériser et quantifier les apports du protocole de cartographie présenté dans ce rapport." (source : auteurs) Type de publication : rapport d'études Référence biblio : Lobry E., Mallard F. (coord.), Couderchet L., 2018 - Programme les sentinelles du climat, tome V. Prise en compte des éléments paysagers dans la modélisation des répartitions des espèces sentinelles du climat. Le Haillan : Cistude nature, 91 p. ID PMB : 70303 En ligne : https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02060194 Format de la ressource électronique : document Permalink : http://www.cbnbrest.fr/catalogue_en_ligne/index.php?lvl=notice_display&id=70303

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Conséquences du changement climatique sur l'écogéomorphologie des estuaires (projet C3E2). Rapport final / Pierre Le Hir (2014)  

Public Titre : Conséquences du changement climatique sur l'écogéomorphologie des estuaires (projet C3E2). Rapport final Type de document : texte imprimé Auteurs : Pierre Le Hir, Directeur de publication ; Institut français de recherche pour l'exploitation de la mer (IFREMER) (Brest, France), Éditeur scientifique ; Université de Bretagne occidentale (UBO) (Brest, France), Éditeur scientifique ; ARTELIA (Hérouville-Saint-Clair (14) - Saint-Herblain (44)), Éditeur scientifique ; Groupement d’intérêt public Loire Estuaire (GIP) (Nantes, France), Éditeur scientifique Année de publication : 2014 Importance : 2 vol. (107 p., 160 p.) Langues : Français (fre) Catégories : [ZG] PAYS-DE-LA-LOIRE (52) [habitats/milieux] 13 - Estuaires et rivières tidales (soumises à marées) [habitats/milieux] ZH - Zones humides [Sites] GS - Estuaire de la Loire Mots-clés : changement climatique  la Loire (fleuve)  environnement  biologie  végétation  risque naturel  sédiment  élévation du niveau de la mer  hydrodynamique  inondation  modélisation  topographie Résumé : "Parmi les systèmes susceptibles d’être impactés par le changement climatique, les milieux estuariens sont des zones à privilégier. Ils constituent des systèmes naturels d’une grande originalité, à la fois en termes de fonctionnalités écosystémiques et en termes de biodiversité. ils sont également des "anthroposystèmes" de grande valeur socio-économique. L’objet du projet C3E2 a été de développer une capacité de réponse à la question du devenir probable des systèmes estuariens, en termes de morphologie et de couverture sédimentaire (caractérisation des biotopes) sous l’effet du changement climatique, et en fonction de contrôles anthropiques éventuels. L'étude a reposé sur l'utilisation de la modélisation numérique, seule approche capable de rendre compte simultanément des processus hydrodynamiques, sédimentaires et biologiques, de mécanismes de couplages entre ces processus, et enfin de rendre possibles des projections sur l'avenir. Ce projet a fait l’inventaire des manifestations du changement climatique en estuaire, et de leurs impacts possibles. A l’aide de modèle opérationnel, il a été montré la sensibilité de la réponse d'un système estuarien aux apports solides qui aujourd'hui sont très mal connus et la sensibilité de l'évolution des marais maritimes à leur profil topographique au-delà de la zone actuellement submersible. Ce projet a permis de caractériser en climat changeant les risques d'inondation des différents secteurs de la plaine alluviale, l'évolution des salinités et turbidités, en particulier dans la plaine alluviale, et les conséquences prévisibles sur la végétation. La recherche a été complétée par l’étude sur un système réaliste, l'estuaire de la Loire, pour lequel la question de l'évolution des marais inondables était jugée cruciale." (source : auteurs) Type de publication : rapport d'études Référence biblio : Le Hir P. (coord.), 2014 - Conséquences du changement climatique sur l'écogéomorphologie des estuaires (projet C3E2). Rapport final. Institut français de recherche pour l'exploitation de la mer / Université de Bretagne occidentale / ARTELIA / Groupement d’intérêt public Loire Estuaire, 2 vol. (107 p. ; 160 p.). En ligne : http://isidoredd.documentation.developpement-durable.gouv.fr/document.xsp?id=Tem [...] Format de la ressource électronique : document Permalink : http://www.cbnbrest.fr/catalogue_en_ligne/index.php?lvl=notice_display&id=66368

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Elaboration et mise en Å“uvre de méthodes d’échantillonnage destinées à évaluer la taille des populations des espèces les plus menacées de Picardie / Geoffroy Villejoubert (2015)  

Public Titre : Elaboration et mise en Å“uvre de méthodes d’échantillonnage destinées à évaluer la taille des populations des espèces les plus menacées de Picardie Type de document : texte imprimé Auteurs : Geoffroy Villejoubert, Auteur ; Université Paul Sabatier. Toulouse III (Toulouse), Organisme de soutenance ; Conservatoire botanique national de Baileuil (Rouen), Année de publication : 2015 Importance : 51 p. Langues : Français (fre) Catégories : [Thèmes] Flore vasculaire (phanérogames et cryptogames vasculaires) [Thèmes] Outils et méthodes [Thèmes] Plante à forte valeur patrimoniale [ZG] HAUTS-DE-FRANCE Mots-clés : dynamique des populations  méthode d’échantillonnage  modélisation  estimation  bootstrap Résumé : "De par sa vocation à conserver les populations d’espèces végétales les plus menacées sur son territoire, le Conservatoire botanique national de Bailleul suit depuis 5 ans les espèces inscrites au titre de l’annexe IV de la Directive Habitats-Faune-Flore présentes en région Picardie. Après ces 5 années de suivis avec une méthode de « comptage pied à pied », le Conservatoire botanique souhaite aujourd’hui tester tout un panel de méthodes d’échantillonnage applicable à des espèces végétales présentant des types biologiques différents (annuelle, vivace…) avec des patrons de distribution différents (population clonale, en patch, …). applicables à la flore rare et menacée de Picardie. Pour cela, les méthodes doivent répondre à une problématique principale : évaluer la taille des populations avec une marge d’erreur jugée satisfaisante par l’ensemble des acteurs de la conservation de chaque espèce sur leur site. L’objectif de cette année a donc été de balayer un ensemble de méthodes d’échantillonnage (adaptive cluster, échantillonnage stratifié…) répondant à cette problématique à travers la modélisation de ces méthodes d’échantillonnage et de leur application sur le terrain quand cela était pertinent. La volonté du Conservatoire botanique est de pouvoir réallouer le temps consacré à la méthode standard pour suivre d’autres populations d’espèces de la flore régionale gravement menacées. Parmi les différentes méthodes explorées, l’échantillonnage stratifié a été identifié comme une méthode pouvant répondre à cette problématique. Elle a pu faire l’objet d’une application sur le terrain confortant les résultats obtenus avec la modélisation de la méthode et permettant d’identifier les éventuels problèmes liés à la réalité du terrain. Il reste néanmoins d’autres méthodes à explorer, notamment les méthodes de type présence/absence ou les méthodes utilisant des statistiques bayésiennes, et à définir la variation d’effectif que l’observateur est capable de détecter et le nombre d’années nécessaire pour pouvoir la détecter grâce aux tests de puissance." (source : auteurs) Type de publication : thèse, mémoire, stage Référence biblio : Villejoubert G., 2015 - Elaboration et mise en Å“uvre de méthodes d’échantillonnage destinées à évaluer la taille des populations des espèces les plus menacées de Picardie. Rapport de stage de Master 2 : Gestion de la Biodiversité Aquatique et Terrestre (GBAT). Rouen : Conservatoire botanique national de Baileuil. Toulouse : Université Paul Sabatier. Toulouse III, 51 p. ID PMB : 72094 En ligne : https://digitale.cbnbl.org/documents/CRP1084.pdf Format de la ressource électronique : document Permalink : http://www.cbnbrest.fr/catalogue_en_ligne/index.php?lvl=notice_display&id=72094

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• Contribution au renforcement des méthodes de suivi mises en Å“uvre afin d’étudier la dynamique d’espèces gravement menacées sur le territoire picard / Antoine Hébert (2017)  

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Programme les sentinelles du climat, tome VII. Vers la mise en place d’une base de données des suivis des espèces sentinelles du climat / Fanny Mallard (2018)    

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Programme les sentinelles du climat, tome VIII. Écologie du changement climatique en région Nouvelle-Aquitaine / Fanny Mallard (2019)  

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Approche intégrative de la stratégie de conservation du Râle des genêts / Université d'Angers. Faculté des sciences (Angers, France)

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Combining top-down and bottom-up dynamics in land use modeling: exploring the future of abandoned farmlands in Europe with the Dyna-CLUE model / Pter Verburg in Landscape ecology, vol. 24, n°9 (Novembre 2009)

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Computer-Assisted Recovery of Threatened Plants : Keys for Breaking Seed Dormancy of Eryngium viviparum / Manuel Ayuso in Frontiers in Plant Science, vol. 8 (Année 2017)  

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Conservation & développement des connaissances : un double objectif pour l'étude des espèces menacées. Exemples de la Renoncule à fleurs en boules et de la Centaurée de la Clape / Florian Kirchner (2005)

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Estuaire de la Loire. Hydrosédimentaire / Claude Migniot (1997)

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Integrating phylogenomics, phylogenetics, morphometrics, relative genome size and ecological niche modelling disentangles the diversification of Eurasian Euphorbia seguieriana s. l. (Euphorbiaceae) / Bozo Frajman in Molecular Phylogenetics and Evolution, vol. 134 (Année 2019)  

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Inventaires et atlas nationaux de distribution : pour une approche plus itérative et un rééquilibrage taxinomique / Julien Touroult in Revue d'écologie, vol. 70, n°2 (Année 2015)

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Measuring succession : methods for establishing long-term vegetation monitoring sites / Merilynn Schantz in Plant ecology, vol. 218, n°10 (Septembre 2017)

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Programme les sentinelles du climat, tome IX. Connaitre et comprendre pour protéger les espèces animales et végétales face au changement climatique / Fanny Mallard (2020)  

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Les sentinelles du climat : proposition d’indicateurs biologiques et préfiguration des protocoles de suivis en Normandie / Mickaël Barrioz (2022)

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La simulation multi-agents pour l’aide à la gestion d’un territoire sous contraintes. Le modèle ouessantin / Quentin Texier (2008)  

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