Résultat de la recherche
6 recherche sur le mot-clé
'marqueur génétique' 
trié(s) par (Pertinence décroissant(e), Titre croissant(e)) Affiner la recherche Générer le flux rss de la recherche
Partager le résultat de cette rechercheEvolution d'un système de reproduction mixte sexuée-aséxuée. Approche génétique et écologique chez Sparganium erectum l / Yves Piquot (1996)
Titre : Evolution d'un système de reproduction mixte sexuée-aséxuée. Approche génétique et écologique chez Sparganium erectum l Type de document : texte imprimé Auteurs : Yves Piquot, Auteur ; Université de Paris-Sud. Faculté des sciences d'Orsay (Orsay), Organisme de soutenance Année de publication : 1996 Importance : 97 p. Langues : Français (fre) Catégories : [Espèces (in biblio)] Sparganium erectum
[Thèmes] Multiplication
[Thèmes] ReproductionMots-clés : marqueur génétique diversité génétique métapopulation évolution allozyme Résumé : "Sparganium erectum (le rubanier), comme la majorité des plantes pérennes, se reproduit a la fois de façon sexuée et de façon végétative. Le cout écologique et génétique de la reproduction sexuée, nous a amené a poser la question de la stabilité a l'échelle de l'espèce d'un système de reproduction mixte sexuée - asexuée par rapport a un mode de reproduction exclusivement végétatif. Nous avons abordé cette question (1) par l'identification de marqueurs moléculaires et allozymiques permettant de déterminer dans quelles mesures les populations naturelles se distinguent par leur diversité génotypique et (2) a travers une étude in situ et en conditions contrôlées de mettre en relation la valeur des traits d'histoire de vie avec d'une part l’âge des populations et d'autre part leur diversité génétique. Nous avons trouvé les diversités génétiques les plus élevés (et les investissements les plus élevés a la reproduction sexuée) dans les jeunes populations tandis que les diversités clonales les plus faibles (et les investissements les plus faibles a la reproduction sexuée) ont été détectés dans les populations anciennes. Ces caractéristiques génétiques et écologiques reflètent la perte de la fonction sexuée a l'échelle de la population. Cette transition pourrait être le résultat d'une augmentation de la compétition entre les clones conduisant a la sélection des génotypes favorisant la reproduction végétative et d'une contre-sélection de la reproduction sexuée. Nous suggérons, à partir modèle d'Olivieri et al. (1995), qu'un système de reproduction mixte peut être maintenu par l'interaction de deux échelles de sélection: une sélection intra-population en faveur de la multiplication végétative et une sélection en faveur de la production de graines a l'échelle de la métapopulation." (source : auteurs) Type de publication : thèse, mémoire, stage Référence biblio : Piquot Y., 1996 - Evolution d'un système de reproduction mixte sexuée-aséxuée. Approche génétique et écologique chez Sparganium erectum l. Thèse de doctorat : Sciences biologiques et fondamentales appliquées (Ecologie générale). Orsay : Université de Paris-Sud. Faculté des sciences d'Orsay, 97 p. ID PMB : 69157 Permalink : http://www.cbnbrest.fr/catalogue_en_ligne/index.php?lvl=notice_display&id=69157 Exemplaires(0)
Disponibilité aucun exemplaire Microsatellite allele sizes : a simple test to assess their significance on genetic differentiation / Olivier J. Hardy in Genetics, vol. 163, n°4 (Année 2003)
Titre : Microsatellite allele sizes : a simple test to assess their significance on genetic differentiation Auteurs : Olivier J. Hardy, Auteur ; Nathalie Charbonnel, Auteur ; Hélène Fréville, Auteur ; Myriam Heuertz, Auteur Année de publication : 2003 Article en page(s) : pp. 1467-82 Langues : Anglais (eng) Mots-clés : diversité génétique marqueur génétique microsatellite Résumé : "The mutation process at microsatellite loci typically occurs at high rates and with stepwise changes in allele sizes, features that may introduce bias when using classical measures of population differentiation based on allele identity (e.g., F(ST), Nei's Ds genetic distance). Allele size-based measures of differentiation, assuming a stepwise mutation process [e.g., Slatkin's R(ST), Goldstein et al.'s (deltamu)(2)], may better reflect differentiation at microsatellite loci, but they suffer high sampling variance. The relative efficiency of allele size- vs. allele identity-based statistics depends on the relative contributions of mutations vs. drift to population differentiation. We present a simple test based on a randomization procedure of allele sizes to determine whether stepwise-like mutations contributed to genetic differentiation. This test can be applied to any microsatellite data set designed to assess population differentiation and can be interpreted as testing whether F(ST) = R(ST). Computer simulations show that the test efficiently identifies which of F(ST) or R(ST) estimates has the lowest mean square error. A significant test, implying that R(ST) performs better than F(ST), is obtained when the mutation rate, mu, for a stepwise mutation process is (a) >/= m in an island model (m being the migration rate among populations) or (b) >/= 1/t in the case of isolated populations (t being the number of generations since population divergence). The test also informs on the efficiency of other statistics used in phylogenetical reconstruction [e.g., Ds and (deltamu)(2)], a nonsignificant test meaning that allele identity-based statistics perform better than allele size-based ones. This test can also provide insights into the evolutionary history of populations, revealing, for example, phylogeographic patterns, as illustrated by applying it on three published data sets." (source : auteurs) Note de contenu : Cet article discute de l'utilisation des marqueurs génétiques microsatellites pour évaluer la différenciation génétique entre populations. Le principal objectif de l'étude est de proposer un test simple basé sur la permutation des tailles des allèles pour déterminer si les mutations de type stepwise (à pas fixes) contribuent à la différenciation génétique.
Type de publication : périodique Référence biblio : Hardy O., Charbonnel N., Fréville H., Heuertz M., 2003 - Microsatellite allele sizes : a simple test to assess their significance on genetic differentiation. Genetics, 163 (4) : 1467-82. ID PMB : 72267 DOI : 10.1093/genetics/163.4.1467 Permalink : http://www.cbnbrest.fr/catalogue_en_ligne/index.php?lvl=notice_display&id=72267
in Genetics > vol. 163, n°4 (Année 2003) . - pp. 1467-82[article]Exemplaires(0)
Disponibilité aucun exemplaire Genetic diversity in Crambe maritima along the English Channel : the role of ocean currents in determining population structure / J.-M. Bond in Ecography, vol. 28, n°3 (Année 2005)
Titre : Genetic diversity in Crambe maritima along the English Channel : the role of ocean currents in determining population structure Type de document : texte imprimé Auteurs : J.-M. Bond, Auteur ; R.E. Daniels, Auteur ; Frédéric Bioret, Auteur Année de publication : 2005 Article en page(s) : pp. 374-384 Langues : Anglais (eng) Catégories : [Espèces (in biblio)] Crambe maritima
[Thèmes] GénétiqueMots-clés : marqueur génétique Résumé : "We utilised genetic markers (ISSR's) to investigate population structuring in Crambe maritima, a coastal perennial found in isolated populations on either side of the English Channel. Despite the expectation that smaller populations would contain lower levels of genetic diversity, we found no correlation with total population size or the number of flowering plants and genetic diversity. Although populations were genetically differentiated from each other, isolation by distance was not apparent in the whole data set or within the UK samples.
Despite being sampled from a wide geographic range, the majority of diversity (71%) was contained within populations, with no unique genotype, or even allele, identifying any population. When genetic distances were plotted using MDS techniques, samples from each population had a tendency to cluster, but the spread of points was wide indicating high levels of gene flow. High levels of gene flow, through the dispersal of seeds, were verified by assignment testing, which showed that 8.7% of individuals were assigned to a population other than the one they were collected from. The pattern of genetic variation can be explained by examining the direction of currents in the English Channel and Bay of Biscay. Gene flow, via seed dispersal, is possible between UK and French populations on either side of the English Channel. In contrast, French populations on the Bay of Biscay coast are effectively isolated by the direction of currents and consequently show a greater degree of genetic differentiation." (source : auteurs)Type de publication : périodique Référence biblio : Bond J.-M., Daniels R.-E., Bioret F., 2005 - Genetic diversity in Crambe maritima along the English Channel : the role of ocean currents in determining population structure. Ecography, 28 (3) : 374-384. ID PMB : 70193 En ligne : https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/j.0906-7590.2005.04148.x Format de la ressource électronique : document Permalink : http://www.cbnbrest.fr/catalogue_en_ligne/index.php?lvl=notice_display&id=70193
in Ecography > vol. 28, n°3 (Année 2005) . - pp. 374-384[article]Exemplaires(0)
Disponibilité aucun exemplaire
Titre : The search for hybrids between Myriophyllum sibiricum and M. spicatum (Haloragaceae) in North Eurasia allowed to clarify their morphological differences and distribution Auteurs : Polina Volkova, Auteur ; Maria O. Ivanova, Auteur ; Alexander Bobrov, Auteur Article en page(s) : 103741 Langues : Anglais (eng) Catégories : [Espèces (in biblio)] Myriophyllum spicatum
[Thèmes] Morphologie végétale
[Thèmes] Plante aquatiqueMots-clés : Myriophyllum sibiricum hybride marqueur génétique Myriophyllum × hybridum aire de répartition Résumé : "Myriophyllum sibiricum and M. spicatum are sympatric in large part of their vast ranges in Eurasia and North America and have different habitat preferences only in East Europe and Siberia. Such absence of both geographic and ecological isolation should trigger extensive hybridization between these species that is indeed observed in North America. The hybrid could be reliably documented only with genetic markers, and in Eurasia this was done only in China. Using genetic markers (ITS2 region of nuclear ribosomal DNA and trnL-trnF intergenic spacer of cpDNA) we documented hybrids between M. sibiricum and M. spicatum on the North Asian Pacific islands with dynamic geological history and climate (Commander and the southern Kuril islands). The hybrid also originated in East Europe (Ivanovo Region) as a result of ecological isolation break due to rapid artificial habitat change. Using genetically verified material throughout temperate Eurasia we clarified morphological characters discriminating M. sibiricum and M. spicatum and, basing on them, refined the species distribution. For the first time we provide a full morphological characteristic of the hybrid between M. sibiricum and M. spicatum and suggest a name for it, M. × hybridum." (source : auteurs) Type de publication : périodique Référence biblio : Volkova P., Ivanova M., Bobrov A., 2024 - The search for hybrids between Myriophyllum sibiricum and M. spicatum (Haloragaceae) in North Eurasia allowed to clarify their morphological differences and distribution. Aquatic Botany, 191 : 103741. ID PMB : 72597 Permalink : http://www.cbnbrest.fr/catalogue_en_ligne/index.php?lvl=notice_display&id=72597
in Aquatic Botany > vol. 191 (Année 2024) . - 103741[article]Exemplaires(0)
Disponibilité aucun exemplaire
Titre : Des marqueurs génétiques pour le suivi d'espèces en danger : l'exemple du Panicaut des alpes Auteurs : Yamama Naciri, Auteur ; Catherine Lambelet, Auteur Année de publication : 2007 Article en page(s) : pp. 15-16 Langues : Français (fre) Catégories : [Espèces (in biblio)] Eryngium alpinum
[Thèmes] ConservationMots-clés : marqueur génétique Résumé : "Divers facteurs détruisent ou menacent la biodiversité, que les causes soient locales {destruction de milieux) ou globales (réchauffement climatique). Certains travaux de recherche permettent toutefois de mettre en oeuvre des actions concrètes." (source : auteurs) Type de publication : périodique Référence biblio : Naciri Y., Lambelet C., 2007 - Des marqueurs génétiques pour le suivi d'espèces en danger : l'exemple du Panicaut des alpes. La feuille verte, 38 : 15-16. ID PMB : 72269 Permalink : http://www.cbnbrest.fr/catalogue_en_ligne/index.php?lvl=notice_display&id=72269
in La feuille verte > n°38 (Année 2007) . - pp. 15-16[article]Exemplaires(0)
Disponibilité aucun exemplaire
Permalink
