eColibry

Une application du Conservatoire botanique national de Brest pour la connaissance des charophytes,
des lichens et des bryophytes
de l’Ouest de la France

  • Charophytes

  • Bryophytes

  • Lichens




eCoLiBry


Connaissance des charophytes, des lichens et des bryophytes de l’Ouest de la France
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Le programme CoLiBry et son application en ligne
  Contexte 
   
Afin de pallier le déficit de connaissance concernant les bryophytes, les lichens et les algues charophytes de l’Ouest de la France, un programme scientifique a été initié fin 2014  par le Conservatoire botanique national de Brest pour collecter et partager des données sur la répartition géographique de ces espèces. Ce programme, dénommé CoLiBry (Connaissance des charophytes, des Lichens et des Bryophytes de l’Ouest de la France) concerne la Normandie occidentale (ex Basse-Normandie) et les régions Bre­tagne et Pays de la Loire. En appui technique de ce programme, un Système d’information et une application de consultation et de saisie en ligne (eCoLiBry) ont été développés.

Quelques éléments de présentation de l’application  eCoLiBry 

Consulter la notice de présentation détaillée.

Groupes taxonomiques pris en compte

Cette première version d’eCoLiBry concerne les bryophytes, les lichens et les charophytes.

 

Territoire concerné

  Fonctionnalités
   
  1. Consultation et export de la liste des taxons recensés dans l’Ouest de la France (noms de référence et synonymes) et des référentiels nationaux,
  2. Affichage des cartes de présence départementale des taxons, en l’état actuel des connaissances,
  3. Information sur la rareté régionale des taxons, estimée à dire d’experts,
  4. Accès à des références bibliographiques concernant ces groupes,
  5. Téléchargement des protocoles de recueil de données de terrain et de la fiche d’aide à l’inventaire des bryophytes et des lichens (à terme des charophytes également),
  6. Saisie d’informations concernant la localisation de stations de ces taxons.
  Qui peut consulter ?
    La saisie d’observations de terrain est réservée aux bryologues, lichénologues et aux charologues qui se sont manifestés auprès du Conservatoire botanique national de Brest et à qui un code d’accès a été délivré. En intégrant le programme CoLiBry, ces personnes s’engagent à respecter le protocole de recueil et de circuit de validation des données élaborés par le groupe de pilotage du programme.

  À quoi servent les informations saisies ?
    Les informations de terrain et d’origine bibliographiques saisies dans eCoLiBry nourrissent les quatre missions statutaires du CBN de Brest :
  1. connaissance de la flore et de ses habitats,
  2. conservation des éléments les plus menacés,
  3. expertises,
  4. sensibilisation et information du public (en particulier des services de l’Etat et des collectivités territoriales).
Plus concrètement, elles sont destinées à fournir une vision globale de la distribution géographique des taxons de lichens, de bryophytes et de charophytes. Par ce biais, le Conservatoire et ses partenaires espèrent pouvoir établir à court terme une première liste des taxons les plus rares et/ ou les plus menacés du territoire étudié et ainsi commencer à engager des mesures d’information et de protection des stations.

  Taux de confiance des données affichées 
    Les connaissances sont encore extrêmement lacunaires. En conséquence, les cartes de répartition affichées ne sauraient constituer une représentation fidèle de la réalité de terrain.  Elles fournissent néanmoins une précieuse information sur l’état des connaissances.
Un indice de rareté régionale est donné pour un certain nombre de taxons. Cet indice s’appuie, faute de données, sur le dire d’experts. Il est attribué sur la base des informations fournies dans la bibliographie et de l’expérience de terrain acquise par les spécialistes de la région.
Les cartes de répartition présentées sont, dans cette première version, alimentées essentiellement par des données publiées plus ou moins récemment. Elles seront enrichies progressivement par les données de terrain saisies dans eCoLiBry.

Les données de terrain saisies dans eCoLiBry sont systématiquement analysées et contrôlées par les animateurs et experts associés au programme avant d’être intégrées au Système d’information. Ce travail scientifique et technique offre la plus-value de eCoLiBry qui vise la cohérence, la fiabilité et la traçabilité des données.
Les données bibliographiques sont issues des catalogues publiés (en particulier du Catalogue des lichens de France – Roux & coll. 2014), et de nombreuses publications anciennes ou plus modernes (pour plus de détails, voir Durfort et al., 2015 et Esnault et al. 2015).

  Comité de pilotage du programme CoLiBry :
    Sylvie Magnanon (directrice scientifique des actions interrégionales du CBN de Brest)
José Durfort, bryologue 
Joël Esnault, lichénologue
Jean Le Bail, charologue et bryologue (CBN de Brest)
Jean-Yves Monnat, lichénologue
Séverine Stauth, bryologue et lichénologue (CPIE du Cotentin)
Dominique Guyader, informaticien  (CBN de Brest)
Claire Laroche, documentaliste (CBN de Brest)
Catherine Zambettakis, déléguée de l’antenne normande (CBN de Brest)

Associés aux experts suivants :

Julien Lagrandie, bryologie et lichénologie
Elisabeth Lambert, charologie (UCO - Angers)
Claude Roux, lichénologie

  Références citées :
    DURFORT J., LE BAIL J., STAUTH S., 2016 - Les catalogues bryologiques des régions Bretagne, Basse-Normandie et Pays de la Loire : méthode d’élaboration et premiers résultats. E.R.I.C.A., 29 : 5-20.
ESNAULT J., MONNAT J.-Y., ROUX C., 2016 - Du Catalogue des lichens de France aux catalogues régionaux : Basse-Normandie, Bretagne, Pays de la Loire. E.R.I.C.A., 29 : 21-32.
ROUX C. et coll., 2017 - Catalogue des lichens et champignons lichénicoles de France métropolitaine. 2e édition revue et augmentée (2017). Édit. Association française de lichénologie (A. F. L.), Fontainebleau, 1581 p; .

 

Protocole standardisé pour l’inventaire et la cartographie des lichens et des bryophytes de l’Ouest de la France
    Télécharger le protocole de recueil de données de terrain - Version complète
Télécharger le protocole de recueil de données de terrain - Version simplifiée
Protocole standardisé pour l’inventaire et la cartographie des charophytes de l’Ouest de la France
    Télécharger le protocole de recueil de données de terrain - Version simplifiée
Télécharger le protocole de collecte et de conditionnement d’échantillons (demande de détermination)
Circuit de contrôle et de validation des données saisies
    Télécharger le schéma
Fiche d'aide à l'inventaire de terrain des bryophytes et des lichens
    Télécharger la fiche
Partenaire technique ayant permis le développement du système d’information eCoLiBry
    Centre Permanent d’Initiatives pour l’Environnement du Cotentin (CPIE)
Partenaires financiers ayant permis le développement du système d’information eCoLiBry
    Conseils régionaux de Basse-Normandie, de Bretagne et
des Pays de la Loire
    DREAL Basse-Normandie, Bretagne et Pays de la Loire
    Fonds européen agricole pour le développement rural en région Basse-Normandie
 
Conservatoire botanique national de Brest
  52 allée du Bot
29200 BREST
Tél : 02-98-41-88-95
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