Les Atlas de la biodiversité communale (ABC) ou intercommunale (ABCi) sont des initiatives locales menées à l’échelle d’une commune ou d’une intercommunalité.
Le diagnostic écologique réalisé dans le cadre de leur élaboration permet de mettre en évidence les principaux enjeux de biodiversité du territoire pour aider à les intégrer dans des démarches d’aménagement et de gestion. Les atlas de la biodiversité sont des outils de sensibilisation et de mobilisation des habitants.
Ils doivent permettre la mise en place d’outils d’aide à la décision et de faciliter le passage à l’action des collectivités.
Ce programme a été lancé en 2010 à l’initiative du Ministère chargé de l’environnement, porté et financé en partie depuis 2017, l’initiative est portée et financée par l’Office français de la biodiversité (OFB) et également par des collectivités locales.
Aujourd’hui, plus de 4800 communes sont concernées par un atlas de la biodiversité.
Le Conservatoire botanique national de Brest accompagne la mise en œuvre des ABC à différents niveaux : mobilisation des données du CBN de Brest pour alimenter les états des lieux, conseils méthodologiques (méthodes d’inventaire et de cartographie des espèces et des habitats, identification et hiérarchisation des enjeux), parfois contribution à l’amélioration des connaissances de la flore et des habitats.
Il est impliqué auprès de plusieurs collectivités qui élaborent ou ont élaboré leur ABC ou ABCi : Pays d’Iroise, Saint-Brieuc Agglomération, Brest Métropole, Angers Loire Métropole, La Roche-Sur-Yon Agglomération…, en collaboration avec différents partenaires associatifs (Bretagne Vivante, Viv’Armor Nature, CEN Pays de la Loire, CPIE Loire Anjou…)
Sur le territoire de la Roche-sur-Yon Agglomération, le CBN de Brest est en effet engagé depuis 2024 dans la réalisation de l’atlas de la biodiversité intercommunale. La Roche-sur-Yon Agglomération, territoire labellisé Territoire engagé pour la nature (TEN) ayant déjà expérimenté la mise en place d’un ABC à l’échelle de la commune de la Roche-sur-Yon, a souhaité élargir la démarche, en 2023, à l’ensemble des 13 communes de la collectivité.
Le CBN de Brest s’est vu confier la réalisation d’une synthèse des données disponibles sur la flore et les habitats, l’acquisition de nouvelles connaissances suite une campagne de terrain en 2024-2025 et une analyse des lacunes en vue d’élaborer une stratégie d’acquisition de connaissances, aux côtés d’autres structures naturalistes (LPO Vendée et GRETIA) qui ont produit les mêmes éléments pour la faune vertébrée et invertébrée.
Les travaux ont été restitués fin 2025. Il se sont appuyés sur l’exploitation de la base de données Calluna ainsi que de bases partenaires (CEN Pays de la Loire, Fédération France Orchidées, Société française d’orchidophilie en Poitou-Charente et Vendée) sur le territoire d’étude. 15 311 données mutualisées ont ainsi été mobilisées pour ces analyses.
Un ensemble de cartes à 3 maillages complémentaires (250m, 1km et 2km) et des chiffres clés ont été produits :

- En moyenne, 13% du territoire de l’agglomération est concerné par au moins un inventaire flore/lichens sur la période 2000-2023 (maillage de 250 m de côté)
- Si on considère le nombre de taxons sur cette même période, 44% des trachéophytes recensés en Vendée sont présents sur l’agglomération, 24% pour les bryophytes, 20% pour les characées et 4% des lichens.
- 18 plantes à enjeux de conservation (inscrites dans les catégories quasi-menacées ou menacées à la liste rouge régionale ou nationale ou à l’annexe II et IV de la Directive Habitats-Faune-Flore) y ont été recensées ainsi que 8 plantes protégées,
- 16 plantes invasives avérées ont été répertoriées entre 1990 et 2023,
- 8 habitats, dont 6 d’intérêt européen, ont été confirmés par des relevés.
Les lacunes de connaissance concernent, sans surprise, la flore non vasculaire et les lichens, ainsi que les habitats, qui restent largement méconnus sur le territoire. Les inventaires ne sont pas repartis de manière homogène sur l’ensemble du territoire et ils ne couvrent souvent pas toutes les saisons. L’actualisation régulière des données est un enjeu du fait de l’évolution des milieux et des pressions anthropiques.
La synthèse des connaissances a permis de poser les bases en vue d’une proposition de plan de prospection en ciblant, notamment, certaines communes déficitaires ou des taxons à enjeu à rechercher plus particulièrement.
Quelques taxons remarquables identifiés sur le territoire de l’ABI :

Renoncule toute blanche (Ranunculus ololeucos) © F. Dortel (CBN de Brest) Coquelicot argemone (Roemeria argemone) © J.Geslin (CBN de Brest)
À l'issue de cette démarche, la commune ambitionne la mise en place de couches d'alerte à la maille de 250m de côté pour constituer une aide à la décision dans le cadre des différents projets portés par la collectivité.
